Chromas(DNA序列分析软件)

　　Chromas是一款十分技术专业的dnf序列分析系统，根据Chromas能够打开ab1、scf、ztr格式的图普文档，根据Chromas能够对这种图普开展合理的剖析，软件适用全自动删掉低品质序列和矢量素材序列，另外软件还适用将图普开展格式变换，进而方便快捷其他软件打开，有必须的可以下载应用。

软件功能

　　1、从Applied Biosystems DNA测序仪打开.ab1色谱图文档。

　　2、打开由别的序列产生器建立或从数据库查询查找的SCF和ZTR格式色谱图文档。

　　3、储存为.scf或Applied Biosystems .ab1格式。

　　4、复印色谱图，在其中包括放缩或合适一页的选择项。

　　5、全自动删掉低品质序列(当品质数据信息能用时)或矢量素材序列。

　　6、以纯文字，FASTA，FASTQ，EMBL，GenBank或??GCG格式导出来序列，或应用基础序号格式化以开展演试。

　　7、将序列以纯文字，FASTA或FASTQ格式拷贝到剪贴板，以黏贴到别的应用软件中。

　　8、翻转和填补序列和色谱图。

　　9、根据精准搭配或最好两端对齐检索子序列。

　　10、显示信息3帧中的汉语翻译及其序列。

　　11、拷贝色谱图一部分的图象以黏贴到文本文档或幻灯片中。

　　12、批处理命令，包含格式变换，带矢量素材删掉的序列导出来，批量打印和原始记录的批量导出。

　　13、应用Nucleics Pty Ltd的PeakTrace RP部件提高.ab1文档，以提升 最高值易读性并获取大量高品质的基本。

使用方法

　　1、挑选File莱单打开一个序列文档，或是立即根据Open打开。

　　2、一般测序中一个反映大约可测的长短为800上下，因为荧光染料的影响和设备特性，测序結果在最初和最终面的情况下有几十个碱基不精确，如下图中白框的一部分。评定测序結果的情况下能够忽视前50个和后50个碱基。

　　3、大家根据菜单栏的放缩专用工具，能够变大或是变小全部主视图：

　　根据图中能够看得出，不一样碱基对应不一样的色调。

　　4、根据菜单栏的“Find'专用工具，能够搜索某一序列：

　　5、根据“File”工具栏的Blast Search能够立即联接在线数据库，将序列开展Blast，省掉了大家打开NCBI等数据库查询随后拷贝序列再核对的不便：

　　点一下OK以后出現以下页面，随后点一下“View report”就可以。

　　6、Chromas还内置序列汉语翻译蛋白质功能，点一下“Options-gt;Show Translations-gt;All”显示信息三条蛋白质翻译序列。这儿往往显示信息三条，是由于Chromas不清楚你的序列汉语翻译的起止结构域，因此 假如你的序列是cDNA序列，那麼这三条蛋白序列中总会有一条就是你要想的，这在大家做蛋白点突变的情况下十分有效。自然假如你的是启动子等别的序列，这一作用是不必要的。

　　7、我们可以将序列导出来，而且能够设定导出来的间距、支行、及其是不是显示信息编号，下边的设定中意味着每60个碱基一行。

　　8、自然很有可能会出现同学们想说，假如我觉得把测序峰图放到文章内容中，我该怎么做?Chromas沒有储存为图片的选择项，这时候很有可能有同学们就想要截屏了，这儿Chromas能够储存为PDF格式，在“File”里边挑选Print 浏览，随后挑选PDF就可以。

　　导出以后就获得PDF格式的峰图了，它是矢量图片，能够无尽变大。随后根据Photoshop作出所必须的图片。