MEGA进化树

MEGA进化树是一款完全免费的分子结构进化基因遗传分析系统，它可以用以生物信息学试验剖析进化树图应用，还能够用以剖析来源于外来物种和物种的DNA和蛋白序列数据信息，可用以序列核对、进化树推论、可能分子结构进化速率、认证进化理论等，APP键入数据信息的格式非常简单，在诸多细胞生物学分析系统中是比较适合制做的一种，特别适合动物学家和科技人员轻轻松松的开展进化剖析和分子结构评定，喜爱的赶紧来试试吧！

软件功能

1、【序列剖析】

系统发育推理

型号规格选择

幽会和钟表

家传我国

选择和检测

序列核对

2、【统计分析方法】

最大似然

间距方式

一般最小二乘

较大的简洁

复合型似然

贝叶斯算法

3、【强劲的视觉效果专用工具】

两端对齐/追踪编辑软件

树探索者

数据信息探索者

热血传奇电机

基因复制指导

時间树指导

使用方法

1、最先依据提醒安裝好APP以后，提前准备必须成就的序列，并将序列储存为fasta格式。

2、开启MEGA7，点击Align--Edit/builtAlignment，选择Createanewalignment，点击ok。

3、开启刚储存出来的fasta序列。

4、点击AlignmentAlignbyClustalW，选择全部序列，发生下面的图，主要参数依据要求改动，在这里大家就立即选择默认设置，点击ok。

5、核对进行后，点击DataPhylogeneticAnalysis，发生下面的图座标箭头符号对准的2个按键。

6、点击Phylogeny，有5个搭建进化树的方式，一般选择MaximumLikehood（最大似然法）、Neighbor-Joining（临接法）和Minimum-Evolution（最少进化法）方式，在这里选择选择Neighbor-Joining（临接法）成就。

7、在TestofPhylogeny选择Bootstrapmethod;No.ofBootstrapreplications键入2000;Mode/Method核酸选择MaximumCompositeLikehood,碳水化合物序列选择Poissonmodel;Ratesamongsites选择Uniformrates;Gaps/MissingDataTreatment选择Compeledeletion,点击Compute获得下边結果，依据自身的要求对树开展装饰。